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Este estudo desenvolveu a estratégia BINDER, que combina edição de genoma in situ com biosensores e triagem por gotículas, para identificar variantes de nucleotídeo único que aumentaram significativamente a secreção de albumina humana recombinante em *Pichia pastoris*, atingindo um título recorde de 23,43 g/L.
Este artigo apresenta o CLUSTER, uma plataforma quimérica bio-ortogonal de 5 kDa que combina a tecnologia SNAP-tag e splicing mediado por inteína para permitir a marcação covalente, eficiente e minimamente perturbadora de proteínas em células vivas.
Este estudo pioneiro valida a viabilidade de uma confirmação multicêntrica pré-clínica para terapias com CAR-T, demonstrando que a superexpressão de CCR8 melhora a migração para tumores sólidos sem comprometer a citotoxicidade e estabelecendo um modelo harmonizado para aumentar a reprodutibilidade e o sucesso na tradução clínica.
Este artigo apresenta uma prova elemente baseada no Teorema do Ponto Fixo de Brouwer para demonstrar a existência de ciclos limites em osciladores biomoleculares e propõe uma análise de alcançabilidade baseada em intervalos para localizar rigorosamente essas soluções oscilatórias.
Este estudo estabelece uma triagem de alto rendimento baseada em CRISPRi que identifica 31 genes reguladores no metabolismo central da *E. coli* capazes de modular a produção de licopeno, revelando novos alvos genéticos para otimizar o rendimento de isoprenoides.
Este estudo quantifica sistematicamente a degradação de proteínas heterólogas em *Synechocystis* sp. PCC 6803, revelando que quase metade sofre degradação significativa e demonstrando que a substituição por homólogos é frequentemente mais eficaz do que a otimização de elementos genéticos para melhorar a produção em biorreatores fotossintéticos.
O artigo apresenta o AncestorGFN, uma abordagem inovadora que utiliza Redes de Fluxo Generativo (GFlowNets) para realizar a inferência filogenética e o design de sequências de forma simultânea e sem alinhamentos múltiplos, demonstrando sua eficácia na recuperação de padrões evolutivos e na descoberta de novas sequências.
O artigo apresenta o SIRIUS, um algoritmo de otimização combinatória baseado em programação linear inteira que gera sequências codificantes de DNA maximamente divergentes para uma mesma proteína, superando métodos existentes ao minimizar subsequências compartilhadas e garantir a estabilidade de construções sintéticas.
Este estudo desenvolveu o framework preditivo YeIP para mapear sistematicamente os efeitos da posição cromossômica na expressão gênica em *Saccharomyces cerevisiae*, permitindo a otimização racional de vias metabólicas, como a do licopeno, apenas pela seleção estratégica de locais de integração no genoma.
Este artigo apresenta um fluxo de trabalho automatizado que integra técnicas de mineração de texto e modelos de linguagem para construir um grafo de conhecimento estruturado sobre a sinalização de células T CAR, facilitando o design de receptores de próxima geração e a priorização de domínios intracelulares.
Este artigo apresenta o InfinMark, um novo framework de esteganografia de DNA que integra a Internet das Coisas e a DNA-of-Things para criar um sistema de anti-falsificação bimodal de ponta a ponta, utilizando nanopartículas de DNA para codificação, marcação invisível e autenticação rápida em múltiplos níveis.
Este estudo introduz pró-núcleos programáveis de DNA como mimetismos nucleares que revelam como o contexto ambiental, incluindo confinamento espacial e propriedades viscoelásticas, modula a separação de fases da proteína FUS de maneira que os ensaios tradicionais não conseguem prever, permitindo o controle da transição líquido-sólido associada a doenças neurodegenerativas.
Este artigo apresenta um framework de controle por realimentação óptica baseado em agendamento de ganho e modelagem multiescala que supera as limitações dos controladores de ganho fixo, permitindo a rejeição robusta de perturbações na expressão gênica de culturas de *E. coli* em batelada ao adaptar-se dinamicamente às mudanças no estado fisiológico celular.
Este estudo humaniza o locus rpb9 na levedura Schizosaccharomyces pombe para demonstrar que a proteína humana POLR2I complementa endogenamente funções conservadas e novas (como formação de heterocromatina e resistência a quimioterápicos), embora apresente divergências específicas na resistência a inibidores de elongação transcricional.
Este artigo apresenta o SurPhACE, uma plataforma de evolução contínua assistida por fago que combina a exibição de superfície em *E. coli* com o microvírus {Phi}X174 para gerar e selecionar nanocorpos de alta afinidade de forma automatizada e em alta escala, eliminando a necessidade de bibliotecas extensas e seleção manual.
Os pesquisadores desenvolveram variantes aprimoradas do interruptor alostérico LightR, com maior alcance dinâmico e cinética de ativação mais rápida, permitindo um controle temporal preciso e reversível da atividade da quinase Src para modelar eventos de sinalização celular transitórios.
Este estudo utiliza qPCR para realizar uma análise quantitativa global de reações de ligação em nanoestruturas de DNA, revelando que a eficiência da ligação varia conforme a posição (bordas versus interior) devido à probabilidade de acoplamento da ligase, mas que essa heterogeneidade pode ser eliminada pelo uso de DMSO como co-solvente.
Este estudo apresenta o CRISPR-MACE, uma plataforma inovadora que permite a evolução dirigida contínua de variantes de Cas9 diretamente em células humanas, utilizando proteínas anti-CRISPR para selecionar mutantes com propriedades aprimoradas, como maior resistência a inibidores e afinidade de ligação ao DNA.
O artigo apresenta o MATCH, uma abordagem bioquímica modular que permite o retargeting programável e específico de receptores de vírus adeno-associados (AAVs) através da conjugação covalente de proteínas de direcionamento, demonstrando eficácia na transdução de células T humanas e no aumento significativo da entrega gênica ao cérebro em modelos animais.
Este estudo desenvolve modelos matemáticos e realiza uma análise de sensibilidade global para o sistema synNotch-CAR T, identificando parâmetros-chave como a associação do ligante, a ativação independente e a força do promotor que podem ser engenhariados para otimizar a dinâmica e a sintonização dessas terapias contra o câncer.